![]()
27
| 4 | 2006
Klinisk Biokemi i Norden
(Fortsætter side 28)
Foundereffekter og screeningsstrategier
I de nordiske landene er det identifisert ulike
foundermutasjoner som ikke er vanlige i andre
populasjoner. I Norge har vi fire foundermutasjoner
i
BRCA1
som trolig daterer tilbake til Svartedauen
[
11
]. På Island, en befolkning som delvis stammer fra
Norge, har de en enkelt foundermutasjon i
BRCA2
[
12
] mens Sverige og Finland har foundermutasjoner
i både
BRCA1
og
BRCA2
[
13;14
]. Foundermutasjonene
i Sverige og Finland er delvis de samme, men alle
disse er forskjellige fra de norske og den islandske.
Blant de publiserte mutasjonsfunnene i Danmark
er ingen definert som foundermutasjoner [
15
]. De
danske laboratoriene som utfører gentesting i disse
genene opplyser at mutasjonsspekteret i Danmark
delvis er overlappende med det svenske.
Kanskje så mange som 70% av alle norske muta-
sjonsbærere har en av de fire foundermutasjone-
ne i
BRCA1
; 816delGT, 1135insA, 1675delA eller
3347delAG. Disse er antatt å være etterkommere av
noen få mutasjonsbærere (kanskje så få som fire)
Figur 2
CSCE av normalvariasjoner i BRCA1 exon 16. Ulik migrasjon i gelbaserte systemer gjør det mulig å skille homo- og
heterozygote variasjoner av 4956A>G samt kombinasjoner av heterozygote variasjoner av 4956A>G og 5075G>A fra
wild type. Sekvensfragmentet som analyseres med de aktuelle variantene uthevet i rødt.
som overlevde Svartedauen for 600 år siden [
16
]. I til-
legg finnes det flere mutasjoner som opptrer med en
viss hyppighet, noe som har resultert i at det er satt
opp FA-paneler som dekker de hyppigst forekom-
mende mutasjonene i den norske befolkningen. Disse
panelene dekker ca 25 kjente mutasjoner og brukes
som den første screeningen av pasienter med mis-
tanke om arvelig bryst- og eggstokkreft. Figur 1 viser
analyse av to av disse panelene sammen, der bl.a.
foundermutasjonene inngår. Sørvest i Sverige er det
vist at
BRCA1
mutasjonen 3171insTGAGA forekom-
mer hos så mange som 65% av mutasjonsbærerne
[
13
], noe som har resultert i at denne mutasjonen
også er inkludert i våre testpaneler.
Blant de hyppig forekommende mutasjonene inn-
går også noen nonsensemutasjoner og disse analy-
seres ved CSCE. I tilegg brukes denne metoden for
screening av de fleste små exons i
BRCA1
og
BRCA2
.
CSCE er en effektiv metode med 100% deteksjon av
alle kjente mutasjoner og kjente normalvariasjoner
